یکی از حوزههای نظریه پردازی آیت الله معرفت اندیشه و فقه سیاسی اسلام بوده است. ایشان با توجه به ارتباط شاگردی با حضرت امام و شرکت در دروس ولایت فقیه ایشان در این موضوع همراهیهای زیادی با امام داشتهاند. در این مقاله سعی شده است موارد اختلاف نظر ایشان با استاد و نوآوریهای ایشان ذکر شود. نقطه نظرهای ایشان دربارة مبانی ولایت فقیه، دلایل و محدودة اختیارات بطور خاص مورد توجه قرار گرفته است.
✔مطالبه گری شهروندان از حقوق اساسی بنیادین شهروندی است که مردم بتوانند بدون ترس وهراس مطالبات وحقوق را مطرح نمایند. ✔ بر اساس نظریه معمار انقلاب اسلامی تشکیل نظام سیاسی با عنوان جمهوری اسلامی متکی به آرای مردم بود که این نظام به لحاظ محتوا از سیره سیاسی پیامبر و امام علی (ع) پیروی میکند؛ ولی به لحاظ شکل و ساختار متکی به آرای اکثریت مردم است.